三峡地区自古为中国历史文化的发源地之一。1997年起，国家正式启动实施三峡库区文物抢救保护工作。在“保护为主、抢救第一”和“重点保护、重点发掘”的原则指导下，来自全国31个文物科研机构及高等院校的110家专业考古单位的数千名专家学者，参加了我国有史以来最大规模的人类文化遗产抢救工程。经过近20年辛勤工作，三峡库区1128处文物已得到妥善保护，发掘出土文物25万余件（套），出版文物保护成果90余部，发表文物保护各类研究论文400余篇，取得了丰硕的保护成果。

三峡库区部分文物分布图

通过地下文物的抢救保护工作，极大地推进了三峡地区古代文明的发现与研究，全面揭示了三峡地区从史前到明清时期的文化发展序列。图为2002年万州区长坪乡冯家河遗址发掘现场。

2008年4月12日，对开县体育场地下文物进行抢救性考古发掘。

万州区武陵墓群考古发掘现场

白鹤梁题刻位于三峡库区涪陵城北，是长江文明代表性文化遗产之一。为了更好地保护和利用白鹤梁水文题刻，2001年，葛修润院士提出了在原址上建立水下“无压容器”博物馆方案，既可以更好地对具有1200年历史的江底水文题刻进行保护，又为科学研究和游人参观提供了条件。

忠县石宝寨抢救性保护工程于2005年12月开工，工程由围堤及护坡工程、危岩治理工程、交通桥工程等五大部分组成。2009年4月17日全面完工，景点重新对外开放。保护后的石宝寨四面环水，犹如一个美轮美奂的巨型盆景，镶嵌于高峡平湖之中。

张飞庙是目前中国最大的文物整体搬迁工程。搬迁严格按照原物、原状、原材料和原工艺，进行整体搬迁。2003年7月19日“搬旧如旧”的新张飞庙正式开馆。这位1700岁的老“移民”仍然可以静享江上清风，观平湖百舸争流。

作为三峡库区地面文物保护重点项目，湖北省文物局确定对屈原祠另择新址复建。2006年11月，屈原祠复建工程开工，2010年6月16日(农历端午节)对外开放。新屈原祠在装饰、灰塑、彩绘等,都继承了原祠的地域特色和传统工艺。